تاریخچه ابوموسی مثل هر منطقه‌ای داستان‌های زیادی دارد و در طول تاریخ نیز فراز و نشیب‌های فراوانی را تجربه کرده است. اما آنچه همیشه روشن است، رگ و ریشه‌های این جزیره را می‌توان از همان زمان تمدن ایلام و ماد و سپس هخامنشی، اشکانیان و ساسانیان و…، در تاریخ ایران جستجو کرد. 

نام اصلی و فارسی جزیره ابوموسی، «بوموسو» است که در طول تاریخ تغییرات فراوانی داشته است و در نهایت امروزه به این جزیره زیبا «بوموسی» و «ابوموسی» گفته می‌شود.

واژه فارسی «بوموسو» از دو بخش اصلی تشکیل شده است؛ «بوم» به معنی سرزمین و «سُو» به معنی سُوز یا همان سبز. به این ترتیب «بوم و سُو» نام اصلی و ایرانی این جزیره است که معنی آن «بوم سبز» یا «سرزمین سبز» است.

از آنجایی که جزیره ابوموسی از قدیم یکی از خوش‌ آب ‌و هواترین مناطق خلیج‌فارس بوده است، مردم بعضی از شهرهای اطراف مثل بوشهر و بندر لنگه، تا ۸۰ سال پیش به این جزیره «گپ سبزو» به معنی سبزه‌زار بزرگ می‌گفتند. همچنین در بعضی از اسناد تاریخی نیز از آن با نام «بوموو» یاد شده است؛ «بوم» به معنی سرزمین و «اوو» به معنی آب.